O desenvolvedor principal da Assassin's Creed Shadows garante aos jogadores que a escolha de um único protagonista não afetará significativamente sua experiência. O jogo apresenta dois personagens jogáveis: Naoe, uma shinobi feminina e Yasuke, um samurai africano histórico-uma escolha que gerou discussão pré-lançamento.
Surgiram preocupações de que o foco em um personagem pode levar à falta de pontos cruciais da trama ou jogabilidade. O diretor criativo Jonathan Dumont abordou essas preocupações, descrevendo sua própria abordagem equilibrada: ele normalmente joga de 3 a 5 horas com um personagem antes de mudar para o outro por 2-3 horas.
No entanto, Dumont esclareceu que os jogadores não serão significativamente desfavorecidos, favorecendo um personagem. Enquanto cada protagonista possui sequências introdutórias únicas e histórias pessoais, a narrativa principal se adapta à escolha do jogador. Ele incentiva os jogadores a priorizar seu caráter preferido:
"O jogo foi projetado para que você não perca muito. É realmente sobre preferência pessoal. Experimente ver como o jogo se ajusta à sua escolha de personagem. Cada um tem começos e missões únicas, mas a experiência principal é flexível. Jogue o seu favorito; a história vai ajustar. "
